A fokhagyma kémiai összetétele nagyon összetett. A fokhagyma 39 egyedülálló hatóanyagain, a kéntartalmú szerves vegyületeken kívül gazdag poliszacharidokban, fehérjékben, illékony olajokban, aminosavakban, vitaminokban, szaponinokban, flavonoidokban, polifenolokban és lektinekben is. Prosztaglandinok, biológiailag aktív enzimek, makro- és nyomelemekben gazdag anyagok. A fokhagyma ezen összetett összetevői jelentik a fokhagyma farmakológiai aktivitásának alapját.
